SWISS﹣PROT 資料厙中可針對關鍵字‵基因‵註解ˋ序列長度ˋ 分子量‵特徵等條件進行多功能之搜尋。各類搜尋條件之簡要說明列於表二。 本文範例中搜尋條件之輸入如下 F tKey‥ disulfideSeqLength 二3:20此輸入表示︰搜尋責料厙中總序列長度在 20 個胺基酸以下(介於3 至20 個胺基酸)且具 有雙硫鍵特徵之胜狀。步驟四 開始搜尋 °步′彌五 針對搜尋之成果進行初步研判 。 初步搜尋之結可能產生下列幾種誤差︰ (1)無法得到任合結果 。 表示責料厙中沒有任何蛋白質符合搜尋之條件 。 4 朝陽學報第六期(2) 雖有結果產生 '卻不符合搜尋之方向。
半胱胺酸由其 硫醇基提供;天冬醯胺與麩胺醯胺則由其醯胺基提供。 monosodium glutamate(麩胺酸-鈉) — 味素成分 兩分子半胱胺酸很容易經由氧化作用形成具有雙硫鍵結之產物胱胺酸(cystine)(圖3-7),此經由雙硫鍵聯結之殘基則變得極為疏水性(非極性)。雙硫鍵在許多蛋白質結構中扮演非常特別的角色,它可能將蛋白質分子的不同區域或是將兩條多作共價鍵結。 圖3-7 顯示兩分子半胱胺酸可氧化形成具雙硫鍵的胱胺酸,胺基酸亦能進行可逆還原反應。雙硫鍵之形成有助於穩定許多蛋白質的結構。 帶正電(鹼性)R 基團 在 pH 7.0 時 R 基團帶最強正電之胺基酸是離胺酸
胱胺酸殘基其中一側的肽鍵以艾德曼降解法打斷時,仍可能藉由其雙硫鍵聯結到另一條多肽上。雙硫鍵也會干擾多肽以化學或酵素方法切割的過程。兩種將雙硫鍵不可逆打斷的方法如圖3-26 所示。 圖 3-26 顯示為兩種常用的方法: 精氨酸以過氧甲酸 (performic acid)處理可將胱胺酸氧化成兩個磺基丙胺酸殘基;以二硫蘇糖醇(dithiothreitol)處理則可將胱胺酸還原成兩個半胱胺酸殘基,再進一步以碘乙酸(iodoacetate)將反應性強的游離硫醇基進行乙基化反應,以避免其再次氧化回復形成雙硫鍵構造。 圖 3-26 打斷蛋白質中之雙硫鍵。切割多肽鏈 有幾種方法可用來片段化一條多肽鏈。
蛋白質食物的紅綠燈中脂肉類每份含蛋白質7兊、脂肪5兊75大卡高脂肉類每份含蛋白質7兊、脂肪10兊,120大卡 蛋白質食物的紅綠燈超高脂肉類每份含蛋白質7兊、脂肪10兊以上,135大卡 蛋白質食物的食品安全肉是什麼顏色才正常 肉是什麼顏色才正常 有注意過肉品櫃的燈光是什麼顏色嗎? 胺基酸肉是什麼顏色才正常你會買哪一個?實際上,這兩種肉都是正常的 肉是什麼顏色才正常變性肌紅蛋白氧合肌紅蛋白脫氧肌紅蛋白
雙硫鍵的定位 如果蛋白質一級結構中有雙硫鍵存在,則它們會在定序完成後,以另一個步驟來決定。取原始蛋白質,先不打開雙硫鍵,直接以胰蛋白酶(Trypsin)切割。所得之胜肽片段與第一次胰蛋白酶切割片段比較。每一對雙硫鍵的存在會造成原有兩個片段消失,取而代之的是一條較長之片段。消失的片段代表原始多胜肽中被雙硫鍵聯結的區域。 由其他方法決定胺基酸序列 由於快速 DNA 定序法的發展、遺傳訊息的解碼以及 基因分離技術之開發,研究者現在已可對基因進行核苷酸定序,間接地決定產物多肽之胺基酸序列(圖3- 28),用來決定蛋白質與 DNA 序列的技術是互補的。當基因可取得時,對 DNA 定序比對蛋白質定序來得更快速且正確 圖3-28 顯示每個胺基酸是由 DNA 中的三個特定核酸序列進行編碼。 圖 3-28 DNA 與胺基酸序列間之對應。
2025年12月3日 星期三
兩分子半胱胺酸很容易經由氧化作用形成具有雙硫鍵結之產物胱胺酸(cystine)(圖3-7),此經由雙硫鍵聯結之殘基則變得極為疏水性(非極性)。雙硫鍵在許多蛋白質結構中扮演非常特別的角色,它可能將蛋白質分子
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